新政变法，陈渊曾施行过一种税务清单的政策，让户部税务监察司的官员，拿着清单下到地方，查办苛捐杂税，现在六月底，各地完成税务查办工作，纷纷上京述职了。
在此次行动中，还真察出了许多问题，虽在去年年底时崇祯已经下召，严令禁止各地的杂税，但一些官员仍顶风作案，该加的加，一丝一毫都没有减少。
其中南方之地现象最为明显，仗着山高皇帝远，官员肆意勾结乡绅，压迫百姓，致使许多小农破产。
“岂有此理，这些人欺上罔下，实在该死，朕定要办了他们。”崇祯得到陈渊的报告后，显得怒不可遏，誓要拿这些人人头震慑地方。
陈渊知道崇祯又要大开杀戒了，忙说：“陛下，苛捐杂税，乃长期积弊所至，非杀一二官员所能解决耳，要除根弊，只有亲自考察当地，才可对症下药。请陛下准许，命我亲自南下，督察南地税务情况。”
崇祯帝犹豫了一会，然后道：“现在新政初立，很多地方都离不开爱卿，如果爱卿走了，这京城事务该如何处理?”
“新政大纲已立，陛下只要根据大纲行事，一切事务自可运转自如，臣相信陛下，也请陛下相信臣！”说完陈渊跪拜在地，不在说话，只等崇祯反应。
崇祯走下案台，扶起了陈渊，言说：“既然如此，那爱卿就放心去吧！要有什么事，你自可于当时觉断，不必拘泥。”
“谢陛下成全！”
三日后，崇祯下召，正式卸任陈渊的户部尚书职，改挂兵部尚书兼都察院右都御史衔，总督南直隶等处地方，提督军务、粮饟、管理河道兼巡抚事，并加授资德大夫。
南京隶京畿之地设总督，在明一代还从未有过的，这也体现了崇祯在用人任事方面不拘于一格。
六月底，陈渊领数百人的车队从京城出发，南下向江南而去。
随车队而行的，大部分都是衣甲卫士。因为陈渊南下，必经中部荒乱之地，所以为安全起见，崇祯调拔了禁军百人保护，除此之外，还有五名锦衣卫贴身而行，将他护的是密不透风。
陈渊知道，崇祯派这些锦衣卫除了保护自己以外，还有监视的意思，虽然崇祯口口声声讲给他便宜行事之权，但说到底却还是放心不下他。
路上，陈渊高骑大马，与兵士们行进着，队伍整整齐齐，一路马不停蹄。
崇祯帝给陈渊配了马车，但他在军伍多年，还是习惯骑马，于是半路上就舍了马车，这样赶路也快了许多。