开始，双方还各自指责对方是用了什么卑鄙的手段，但后来越发紧迫的局面，令彼此间的指责也都顾不上了.在这种情况下，战争再也不可能进行不下去了。北方政府军迅速抛出了橄榄枝，表示要终止战争状态，愿意与南方部落联军共建蒙塔亚的和平局面。接下来，双方以令外界惊讶的速度草签了一个协议，表示继续承认《纳特尼（河）妥协方案》，然后北方军就狼狈地撤回了纳特尼河以北。
但谁又能知道，这仅仅是一个开始。
疫病，并没有随着战争的结束而结束。相反，因为战争的结束，北方军的北归。大量聚集在一起的人口开始移动和疏散，疫病出现了更为严重的扩散和流行。
大量的人员开始死去，甚至一些部族、村落整个地消失在伊玛拉草原上。原先一些兴盛的部族，到最后死得只剩下几个人。到后来人们甚至不敢单人出行或走远，因为人走在路上就有可能倒下死掉——不能及时发现和焚烧的尸体，可能会成为新感染源……
几个月的时间，当旱季再次到来的时候，伊玛拉草原上的人口已经呈现出了令人恐怖的缩减。据后来联合国的有关调查：战前，蒙塔亚南方各部落人口总数约为三百四十五万；近一年的战争状态，随着北方部族与南方部族间的仇杀，南方部落区人口骤减近七十多万；接着，可怕的疫病流行更是夺去了近百万人的生命，整个南方部落区人口骤减至总数不到七十万，可谓惨绝人寰。
与此同时，蒙塔亚北方也无法避免疫病的侵袭。由于北方军狼狈北逃，而且在北撤的道路上没有进行应有的处理措施，导致疫病在蒙塔亚北方也迅速地流行起来。更令人愤恨的是，愚蠢的北方军政府，因为担心自己在南方部落区所犯下的战争罪行被国际社会知晓，竟然一度禁止外国记者入境采访，采取了严格的新闻管制措施，结果造成了疫病传播信息的不透明。
直到最后，由于疫情越来越严重，并呈现出向境外扩散的趋势，这才引起了邻国和国际社会的注意。在国际社会的支援和一些人道组织的帮助下，大量的药品和医疗器械被运抵蒙塔亚，一些有经验的防疫组织和医疗队也深入到蒙塔亚南部部落区。在各方面近一年的努力后，猖狂肆虐的的疫情才逐渐被控制住。
如此一来，作为战争的始作俑者——蒙塔亚军政府的丑行也被曝光。最终，战争的发动者曼帕塔将军，被他手下的实权派将军马苏阿里取代。曼帕塔则在国人的谩骂和国际社会的指责下，身染重疾，郁郁而终。
疫病得到完全