在大木博士的心中一直有一个秘密。曾经他在成都地区旅行的时候，遭遇了一场跨越时空的旅行。在那次旅行中，他因为保护被猎人追捕的时拉比，而穿越到四十年后的时间。（穿越四十年为神奇宝贝百科数据）
在四十年后的世界里，他因为保护时拉比与当时的小智一行人同行，在旅途的过程中成为了非常要好的朋友。而在那段旅途的最后，大木博士与时拉比最终共同回到了四十年前的世界。而与小智的友谊也告一段落。
但是大木博士坚信不论处于哪一个时空，他与小智的友谊永远存在。
直到在十多年前大木博士在真新镇遇到了还只有两三岁的小智。
虽然大木博士很快就确认了小智的身份，但是他知道这时候的小智还并不是他的朋友。他的朋友小智应该是一位热血的宝可梦训练家，而且有着一只非比寻常的皮卡丘。
但是现在，大木博士看着眼前的素描本的画像，感受着自己口袋里圆滚滚的精灵球。内心不知道在想着什么。
‘原来如此吗？是这样吗？哈哈哈哈！’大木博士的脑海里思绪万千，但是最终只留下一道。‘看来我是小智与皮卡丘那奇迹般相遇缘分的起因呢！’
大大的笑容洋溢在大木博士脸上，自己未来的朋友与他命中注定的宝可梦是在自己的手中邂逅从而成为伙伴，这是多么的奇妙与不可思议啊！
而一旁的悠木看着大木博士从焦虑到思索、再到沉思，再到狂喜，并未表示什么，他早已习惯了这些宝可梦博士的不正常。
“叮！”
高科技仪发出了声响，悠木从中取出了晶莹剔透的能量方块，看这成色，十分不错呢！应该至少有着虹色能量方块的水平。
‘希望钥圈儿会喜欢吧。’悠木内心祈祷着，那个小家伙的口味可是很挑剔呢。
大木博士也被声响重新换醒，摇摇头，收起心中的思虑，准备为自己未来的挚友操作一番初始宝可梦。大木博士知道无论是怎样的初始宝可梦肯定没有他现在手中的这只皮卡丘适合小智。
而一转头看到了正把能量方块喂给钥圈儿的悠木，大木博士神色十分欣慰。
如果说小智是自己的忘年交挚友，小茂是自己最心爱的孙子，那悠木则是自己如今最满意的学生与助手。
在一开始的时候，大木博士只是按照和悠木父母的约定照顾悠木，但慢慢的悠木用自己的能力证明了自己，两人间也从师生关系慢慢变成了助手关系。