在这些复明军将士的期盼中，众人刚敢集结好队伍，朱由栋也带着周昌等人来到满城外。这时候的满城，就是以前的大明皇宫，看着眼前的巍峨宫殿。众人不由的感慨万千，大明皇宫沉沦十五年后，大明终于又回来了。
正在众人感叹的时候，已经投降的苏松巡按马腾升忙道：“殿下，这里虽然被鞑子据为满城，但是其本质乃是我大明的皇宫。如果真的就此屠城，是不是有上皇家运势。等到殿下在进入皇城居住，爬会感到杀戮太重了。”
朱由栋毫不在意道：“没事，满洲人在皇城里犯下了罪孽，当然要用他们的鲜血来清洗。我大明的皇宫，岂是他们这些野人，鞑子能随意居住的。”朱由栋想了一下，考虑到城里的宫殿。如果毫无顾忌的让军队进去屠城，怕到时候，真的就成了一片废墟了。
想到这些，朱由栋当即，对准备攻打满城的王兴等三人道：“进城以后，不管城里的人是满是汉，一律全部诛杀。城里的金银财物，归攻城的将士所有。但有一点，除了战事必要破坏的，任何人不得损毁城里的建筑。”
王兴等人立即答应道：“殿下放心，我们一定保护好城里的宫殿，不让将士们损毁。”朱由栋挥手道：“我到不是舍不得那些破房子，只是如果真的破坏了，到时候再修这些宫殿，不知道又要耗费多少民力。如果能保存下来，当然是最好的。好了，攻城吧，尽快结束皇城里的战事。”说完朱由栋便直接离开了。
而马腾升则跟在朱由栋后面，道：“殿下真是爱民如子啊，如今才刚刚光复南京，如此爱惜百姓。真是百姓的天大的福分，大明万幸，天下百姓万幸啊。殿下果然是从古至今，天下无双的圣主。”听见马腾升的话，朱由栋不由的又放快了脚步，真怕自己就迷失在马腾升的马屁里了。
等朱由栋回到应天府，对蒋超和马惟兴道：“现在你们的军队也休息一天了，蒋超，你下午就带领军队南下，去接应苟兴旺。击退清军援兵后，乘势攻取广德和宁国二府。马惟兴，你带领军队往东，如果夏国相和杨明遇没有攻下镇江，你就出兵一起攻打镇江。”
两人忙拱手答应，然后马惟兴问道：“殿下，如果夏国相和杨明遇二位将军，已经攻下了镇江，末将该去何处呢？”朱由栋想了一下道：“那你就与水师一起，攻打扬州。不一定要攻下扬州，但一定要消灭清廷在瓜洲的操江水师。”
朱由栋又对林壮道：“你派人跟马惟兴一起去，如果已经攻下镇江，就让夏国相带兵攻常州。让范绍祖带领洞庭湖水师