堆积
皇甫嵩、朱俊一边写捷报送去朝中，等候朝中旨意，一边着处置俘虏经过颍川、汝南两战，汉兵损失不小，皇甫嵩、朱俊经过商量，决定不再坑杀俘虏，而是从中选精壮可用者八千余人，充入军中，余下的悉数转给赵谦，由他发落安排
汝南黄巾对汝南造成的损害远比颍川黄巾对颍川造成的损害大，颍川黄巾因为没有下阳翟，受到荀贞的抗击，所以只是对颍川郡南的几个县造成了比较大的危害，而汝南黄巾却几乎把汝南全郡都下来了，下来后烧杀抢掠，接着汉兵入境，又激战不断，使得大量的人口或死在乱中，或逃亡它地，连郡治平舆如今都是十室六空，其它的县可想而知战乱耽误了春种春耕，虽然现已是四月，补种粮食是来不及了，可在其它地方，比如修缮城墙、修治县寺等等方面却也是需要大量人的，有了这批俘虏，减轻了赵谦不小的压力，他欣然接受
荀贞部本有千二人，伤亡三余，尚存九人，在受降了何仪后，他从黄巾军的俘虏中选出了二人，给何仪带领，但这区区两人不够补充他的损失，为了接下来的战事，皇甫嵩拨给了两千俘虏，由他自行编制他本部只有九人，俘虏两千人，远多於他的本部，为了编制这两千人，他绞尽脑汁，最终采纳了荀攸的意见，从其中选出三，乱编入本部，将剩余的一千七人并与何仪所部之两人，共计一千九人编为两部，一部九人，由何仪统带，另一部千人，由许仲、刘邓统带，从本部中选了一些武勇的亲信充任中低层的军官，其中包括原盼等这些投奔他的繁阳亭太平道信徒至於许仲、刘邓原本统带的蹶张士、陷阵士，改由陈到、典韦统带在汝南的这几场仗，典韦、陈到立下了很大的功劳，可以任用了
经过整编，荀贞部从早先的一千二人扩充到了三千一余人傅燮、孙坚等部也各有扩充，孙坚部早先也是千余人，如今亦扩充至了三千余人当然，不是所有的汉军部曲都得到了扩充，皇甫嵩是按照战功拨给他们俘虏的，战功小的扩充的就少，没战功的就得不到扩充
四月中旬，全军整编完成，入颍川前汉军四万余人，现有近五万人，从整体上来说，规模并没有得到扩大，仍与原本的兵额相仿这却也是皇甫嵩的谨慎之处历经大战，汉兵总计伤亡六千余，战力受损，不补充不行，可也不能补充太多，补充太多说不定就会引起朝中的猜忌自古以来，领兵出战固是一个获取功名利禄的捷径，可却也不乏因战功太大而反而获罪的皇甫嵩、朱俊又算是党人清流一派，更得时刻防止宦官们的暗算，万不能倒持太阿，授人以柄