的信任后，小智认真地开展他的旅程来挑战各地的道馆，参加宝可梦联盟。在旅途中加入小智的是两位良师益友——小刚和小霞。
参加石英大会后，小智受大木博士委托启程前往橘子群岛，从内木博士那里取得GS球，小刚暂时留在内木博士那里。旅途中小智参赛橘子联盟，还遇到宝可梦观察家小建，便与他一同旅行。回到真新镇后，大木博士无法理解怎么样把GS球打开，所以就把小建留下做助手，派小智、小霞、小刚前往城都地区，把GS球交给桧皮镇的钢铁先生。后参加了宝可梦联盟－城都联盟的白银大会。
城都联盟篇结束后，小霞为了接替出门旅行的三位姐姐而不得不返回华蓝市担任道馆训练家，小刚也因为因家里有事和小智分开了。小智重新出发，因为想要以一个新人的心态继续学习的心态，所以只带着皮卡丘只身前往丰缘地区，在那里认识了新人训练家小遥和她弟弟小胜，后来小刚又重新加入，于是四人并展开全新的冒险。超世代共分为丰缘联盟及对战开拓区两篇，和第一部的不同的是，故事变成了两条主线：一方面小智为了参加丰缘联盟，努力挑战道馆而收集徽章。联盟大会结束后，改挑战故乡关都地区的对战开拓区；另一方面小遥以成为顶级协调训练家为目标，挑战各地的华丽大赛取得缎带，参加华丽大型庆典。两人都为了达成各自的目标，与宝可梦一起奋斗。
......
其中故事主角小智。
恰好还是徐来所在常青一中的学长。
现在算起来。
这位小智学长人已经上大学了。
两人年龄算起来，应该差四岁。
差不多，徐来上大学的时候，小智也已经大学毕业了。
唉。
就这样完美错过了，还真有些不甘心啊。
徐来起身，最终没有对那个波波下手。
因为自己手里面精灵球有限。
而他手里面的精灵球也就十个。
如今已经消耗了四个，回收了一个。
剩余七个。
每一个精灵球的价钱是200块钱。
徐来可是出了名的穷，是真心支援不出太多钱浪费。
更别说出名的豪华的大师球了。
“所以，要把他们给打残了，让他们没法再战斗，再行收服才行。”
徐来放过了波波之后，波波这才反应过来草丛里面竟然藏了一个人，被吓到的它急忙逃走。