人类的历史遭遇过很多危机，可文明依旧生生不息，许多人也认为这一物种会永世长存，然而崩坏元年的基金会入侵却是打破了这种幻想。
没人知道它们从何而来，那些入侵地球的神秘基金会像审判长矛般插在这颗蓝色星球上，无止境地向这个世界释放恐怖的余波，世界范围内，各大城市全面沦陷，人类社会原本的秩序彻底崩塌，海洋变为黑水，森林化作沙漠，世界几乎成为一片废土。
当如同山岳般的凶兽向着阵地冲来，恐怖的瘟疫夺走人类的健康，辐射力场摧毁着体内的细胞，死去的士兵化作丧尸嘶吼着又爬起来，世界各国的军队惨遭击溃。为了给人类保留最后的火种，各国首脑下达了撤退指令，不再进攻立方体，而是在偏远地区固守。在这些改造成幸存者基地的城市中，
人类科学家利用最先进的材料建立起百米高的生命之墙，阻挡着怪物的入侵，同时研发了可控的小型生物圈，给城内的人类建立了一个可持续生存的环境，一切资源自给自足，从此固守。就像猪，就像狗，就像神圈养的畜生，人类像家禽般被养在城内，依托生命之墙的坚固，连看都不愿意看一眼城外的废土，他们欺骗自己这就是最好的生存方式，只要每天吃得饱，穿得暖，能活下去，这就够了。
自此，人类迎来了最颓废的时代。不过，在多年之后，事情出现了转机，或许是人类意志的必然性，一批渴望自由的志愿者组成了联合远征军，毅然决然地冲出了高墙，踏上了那片被人类抛弃已久的废土。
没有人认为他们能活着回来，在他们走出高墙的一刻，民政官就把他们写成了死人，甚至提前给家属下发了抚恤金。
可是没有人想到，有人最终回来了，还带来了一个震惊世界的消息！他们告诉墙内的人，那些入侵的立方体拥有极高的智能，不知目的为何，但它们为人类打开了进化通道，只要完成立方体所下达的指令，进化之门便会敞开，传说中的血统，基因进化，高科技武器，以及一切想得到想不到的东西。屠杀了几十亿人口的立方体，最终又为人类打开了进化的大门？亲手赋予人类复仇的钥匙？
像个笑话，更像一个玩弄！然而，至少有一点是确定的，立方体带来的，不仅仅是灾难与毁灭。自此，越来越多的有志之士冲出了高墙，重新踏上了那片废土，向着那片被怪物吞噬的家园进发，或为一己私欲，或为再度崛起，每一个人都在为自己的信念奋战。
废墟中，人类历史翻过崭新的一页，在那遥远的未来中，当后人拨开