管的头颅扔在殿门内，群臣无不惊惧。
董卓大声道：“请陈留王入殿！”
蔡邕、刘虞、杨彪等人簇拥着陈留王刘协入得殿来，董卓扶刘协坐上皇位，然后跪倒在地，行大拜之礼，刘协即位，谥号孝献皇帝，即汉献帝，为阅读方便，本书后文均用献帝称呼。
群臣见董卓大势已定，也只好跪倒，山呼：“吾皇万岁万岁万万岁！”
刘协按着事先学的礼仪，扬手道：“诸位爱卿平身！”
“谢皇上！”齐声的呼喊在宫中持续回荡。
侍中大夫杨彪宣道：“新皇登基，改元初平，大赦天下！”
何氏和刘辨跪于阶下，直到刘协登基仪式结束才被武士带走，董卓令武士带何氏、刘辨和刘辨的皇妃唐氏去永安宫居住，然后紧锁宫门，严禁群臣任何人进入。
几天后，献帝下诏，拜太尉刘虞为大司马，封襄贲侯；拜董卓为太尉，领前将军事，加节传、斧钺、虎贲，加封郿侯；拜董旻为左将军，封鄠侯；拜姜盛为右将军，封益侯；加封吕布为都亭侯，董卓部下也均有封赏。
为了稳固实力，李儒为董卓出谋划策，大肆提拔清流党人，以安天下。
在董卓的掌控下，献帝又先后下诏，拜杨彪为司空，黄琬为司徒，王允为太仆，恢复陈蕃、窦武及其党人的爵位，提拔他们的子孙。
本来清流党人对董卓废立之事颇有怨言，见董卓也并非只用自己的人，本来清流党人被阉党打压，都得不到任用，此时董卓给了他们机会，所以清流党人的反董言行都销声匿迹了。
何进被杀后，宫中各郎署衙门的宦官都被袁绍率军铲除，为了填补属官空缺，董卓矫诏恢复郎官履职，从此宫中各署又恢复了士人主事而非阉人主事的规矩。
且说何氏、刘辨及唐妃居于永安宫，董卓逐渐断了他们的供给，日子日渐困苦，但董卓还是不放心，就派李儒去除掉他们。
李儒奉了毒酒入内，说道：“皇上念及手足情深，特赐酒于弘农王，请弘农王饮用。”
何氏道：“既是皇上赐酒，请大人先饮。”
李儒扔下一把短刀和七尺白绫，喝道：“不喝酒，就赐此二物，你选！”
唐妃哭道：“妾愿代皇上饮此酒，还望大人放过太后母子性命。”
“该掌嘴！妄称弘农王为皇上，你是什么身份？岂有资格代王饮酒？”李儒喝道，又对何氏道：“你先喝还是弘农王先喝？”
何氏大骂道：“