组织、细致谋划的针对所有华人的大抢劫、大屠杀悄然降临。
从明朝中期开始，就有大量的中国侨民到东南亚去谋生，今天的东南亚的华人又很大一部分就是当时的移民后裔，西方殖民者来到之后，不断的迫害华人，多次进行了有组织的针对华人的屠杀。
第一次有记载的是发生在1603年西班牙殖民者统治下的菲律宾，当时死难的中国同胞据《明史》记载为25000人，福建巡抚估计为3万人，西班牙殖民者估计为23000人）而华侨损失的财产则难以估计，据事后拍卖，拨为军用者36000多比索，缴入“皇家金库”者3万多比索。
大屠杀后，致使马尼拉没有理发师，没有裁缝，没有鞋匠，没有厨师，没有农民和牧民；“没有粮食吃，没有鞋子穿，即使出极高的价钱也买不到”。
1639年的第二次大屠杀，致使吕宋岛华侨基本上绝灭了，全菲遇难华侨共达22000一24000人。“有几条河里的水被尸体污染得不能食用达6个月之久，（马尼拉）周围许多里格以内，河里的鱼是吃人肉长肥了的，所以人们连鱼也不能吃”。
1662年的第三次大屠杀，据推测被杀害的华侨不下25000人。一个西方历史学家说：“西班牙人的原来意图是要杀尽每一个中国人的。但后来考虑到缺乏商贩和手艺人的不便，便放弃了这个意图。
1762年，西班牙人对华侨实行第4次大屠杀，遇难华侨近2万人。西班牙殖民者发布命令“杀掉所能找到的一切中国人”，宣告所有华侨都是西班牙的叛徒，在什么地方发现，就在什么地方绞死。
于是西班牙殖民者四处搜捕，形成一个“骇人听闻的屠杀高潮”。它们残酷地把10～15个人的辫子联结在一起，再系上石头，投入海河，活活淹死。殖民者的强盗行径勾画出吃人魔王的丑恶嘴脸。
然而最令人可气的是第一次屠杀发生后，当时的福建巡抚（这个人我不想提他的名字，因为离现代太近了，说不定还能找到他的子孙后代）对皇帝上书时居然还谴责所有被杀的华人都是愧对祖坟的逆子，不值得陛下关心。
时间到了20世纪，二战之后，印尼取得独立地位，开始推行一系列同化政策，在经济与文化上对华人实行诸多限制。
1965年“9?30事件”后，苏哈托领导的军方将苏加诺推翻，同时展开了规模空前的排华与大屠杀，华人遇害者人数一直未有正式统计，学界的说法从20万到30万不等。