肉方面，游泳可以和跑步相媲美。比起跑步，游泳也有一些优势，水能为身体提供支撑，因此一些跑步者经常受到的伤害和损伤，对于游泳者来说，这都不是事。
游泳锻炼后，身体恢复的速度要远远快于跑步锻炼后身体恢复的速度。因此，作为跑步的一种替代运动，游泳经常被纳入特种部队的体能训练计划之中。也用来作为跑步训练计划后恢复身体的一种运动，尤其是在海军特种部队中。
但是游泳并不能完全替代跑步，有些肌肉组织，只能通过跑步运动才能得到加强。为了达到训练目的，蛙泳和自由泳是比较好的游泳姿势，后者由于需要正确的呼吸技巧，因此比前者的难度更大。