朱由检镇守马六甲的消息很快便传至南洋藩属和欧洲殖民强国那里，虽然他还没有被加封为亲王，但作为皇帝的亲弟弟身份是何等尊贵，这足以看出明朝对马六甲是志在必得。由于欧洲还深陷“三十年战争”，新旧教派之间的矛盾已经不可调和，英、荷、西、葡势单力孤，只能暂时依附于华远贸易公司，通过明朝商人进行贸易活动。
至于那些与奥斯曼帝国交好的小国，朱由检利用和暹罗公主甘雅的关系，不断在暗中帮助暹罗扩张领土，没用两年便将马来半岛上的外来势力驱除。战后两国以槟城和北大年河为界签订《新港条约》，互相承认对方在马来半岛的主权，明朝终于迈出了大洋争霸最坚实的一步。
此时日本、朝鲜、吕宋、安南、占城、暹罗、爪哇等国都有明朝外交使臣和商人的影子，中华文化圈的影响力已经渗透到他们的日常生活当中，大明作为宗主国可谓一呼百应。不过在风光的背后，中原地区承受着年复一年的天灾。
根据《汉南续郡志》记载：“崇祯元年，全陕天赤如血。五年大饥，六年大水，七年秋蝗、大饥，八年九月西乡旱，略阳水涝，民舍全没。九年旱蝗，十年秋禾全无，十一年夏飞蝗蔽天，十三年大旱，十四年旱。”
简单来说，在小冰河气候的影响下，旱涝肆虐导致耕地面积和粮食产量大幅度的缩减，加上蝗灾、瘟疫泛滥，一些重灾区的百姓流离失所，成为无家可归的难民。
在朱由校登基之初，为了应对小冰川的侵害便开始布局，先是通过实施以工代赈组织各地百姓修建大量的水利设施，然后在全国境内推行一条鞭法和摊丁入亩，提高农民的生产积极性，减轻他们的税赋压力。天启四年朝廷正式推广玉米、土豆、地瓜、番茄等外来农作物，不仅提高了土地的产量，还减轻了天灾对农业的影响。
朱由校本以为在自己的部署会让大明平稳的渡过这场灾难，可是他低估了瘟疫的破坏性。自从甘肃境内爆发了第一起肺鼠疫以后，这种病毒便难以控制，在当时的医疗条件下这是一种可以无限传染的绝症，很多村落发生了户丁尽绝的惨状。
在封建社会，天灾被人们认为是上天的惩罚或警示，皇帝往往会斋戒祷告，表示要尽人事听天命。为了安抚朝野的恐慌局势，朱由校白天命人在先农坛搭设灵台，亲自向昊天上帝祈祷；夜里则找来钦天监里的中西气象专家，认真比对中原地区的气候波动数据。待一切明朗之后，他这才召集太医院的陈司成、吴有性，钦天监的李祖白、陆仲玉，以及地理学家徐