武在梁山从来捞不着露脸的机会。朱武精通阵法，但宋江一直都在用村学究吴用来打压朱武。排坐次的时候，故意把他排到了地煞星里面。
燕青知道，宋江请人偷偷地刻了一块石碑，然后又让人把那块石碑埋在地下。
那块石碑上的名单，是宋江让吴学究拟定的，只是在最后定稿的时候，宋江用朱砂笔勾了朱武的名字，将原来排名37武松，跟朱武换了位置。
朱武自知在梁山永无出头之日，所以一直都表现得与世无争，一直都在寻找从梁山脱身的办法。征方腊的时候，他跟卢俊义一起去南方，虽然跟燕青在一起出征，但两个人之间素无私交，朱武见燕青突然造访，不由得警觉起来。
燕青拿出一朵金花，送到了朱武的面前，燕青说：“是姐姐请军师出山，既帮了我们，同时也帮了汴梁城的百姓！”
朱武两眼一翻，冷笑道：“我就是一个百姓，汴梁城有满朝的文臣武将，官家坐镇，几十万禁军，要我这个来酒馆的做什么？”
燕青说：“听姐姐说，军师熟知阵法，胸藏百万甲兵，只可惜在梁山泊，辱没于刀笔小吏之手，雄才大略无处施展，现在姐姐做了京城女兵的统领，所以请军师出山！”
朱武听罢，哈哈大笑道：“
若是官家找我，我是一定不肯去的，若是三娘叫我，我自会去！”
神机军师朱武自从一上梁山，就在心里暗恋着扈三娘，王英喜欢吃人的心脏，扈三娘受不了他的血腥味，扈三娘跟王英闹过好几次离婚，结果都让宋江给压了下去，因为王英是清风山系的核心骨干，是宋江最早的心腹。王英和扈三娘这桩婚姻，本来就是宋江从林冲手里抢了如花似玉的扈三娘，送给了他的好哥们。
王英娶了扈三娘，正应验了一句老话：“好汉无好妻，赖汉娶花枝”，这桩婚事亮瞎了梁山泊众多老少光棍的眼，其中受刺激最深的，就是神机军师朱武。
有一次，神机军师朱武从断金亭路过，看见扈三娘正在跟孙二娘哭诉他们家夫妻打架的事，本来若论拳脚功夫，王英不是扈三娘的对手，但王英有宋江撑腰，有一次三娘逃到了寥儿洼，假称奉宋江的将令出山，结果宋江命水军头领将三娘绑了，直接送到了忠义堂。
谎报将令出山，是要杀头的，结果宋江却把扈三娘交给王英，说是让王英管教他的娘子。
王英将扈三娘吊在树上，狠狠地抽了一顿鞭子，朱武怕扈三娘有生命危险，他暗中去求菜园子张清夫妻去向宋江求情，这才保