在黑山呼延谷与突厥降户相遇，郭知运纵兵猛攻，击败突厥降户，将张知运救出。同年，郭知运兼任陇右经略使，驻守柳城。
神龙五年七月初五日，郭知运率军在九曲之地大败吐蕃军，将俘虏献于京师。
神龙六年，郭知运再次率军攻打吐蕃。郭知运趁其无备，率领轻装骑兵夜袭九曲之地，大败吐蕃军，缴获精甲、名马、牦牛等数以万计。唐玄宗接到捷报后，将战利品分别赏赐给在京任职的五品以上文武清官和朝集使三品官员。同时提拔郭知运兼任鸿胪卿、代理御史中丞，加封太原郡公。
神龙八年，兰池州胡人康待宾诱使诸降户发动叛乱，于同年四月攻陷六胡州，众达七万人，进逼夏州。圣人诏命郭知运与朔方大总管王晙共讨康待宾。王晙认为：“朔方军兵自有余力，其郭知运请还本军。”便上奏朝廷。但郭知运很快便率军赶到，在听说王晙之事后，心中不快。结果二人在配合上也不密切；郭知运率军攻打王晙已招降的叛军，叛军以为被王晙出卖，于是相继叛走。直至七月初四日，王晙才将叛军彻底击败，生擒康待宾，斩杀叛胡一万五千人。七月十六日，康待宾在长安被腰斩。郭知运因功升任左武卫大将军，一子被授任官职，赐金银器百事 、杂彩千段。
郭知运与王晙在西北并称王郭，胡人皆畏之。
但后来王晙回朝任兵部尚书，郭知运与其不合，有一次在麟德殿醉酒失仪，与王晙争论差点动手，遭到圣人呵斥，郭知运遂自乞骸骨，辞去左武卫大将军职，一直赋闲在家，
郭知运在任期间，搜集一批西域的曲谱，进献给唐玄宗，其中便有著名的《凉州曲》。
想着郭知运还不到五十，有名望有战功还好文，还赋闲了两三年，拉到长从宿卫做镇营之神亦不错，于是独孤心慈遂写了一封信让秦冲遣人送给王晙尚书。
信中直接了当的说起长从宿卫缺少老将镇营，汝不来让郭知运来，不然汝再给某弄一个与汝等差不多名望的来。
第二天，兵部尚书萧嵩带着人来辋川了。
“汝倒是好享受？这儿清凉如春，真是洞天福地啊？”萧嵩不知是埋怨还是羡慕。
“凉快就多玩两天，抱着什么物事？带来这么多人来蹭饭啊？”独孤心慈与之熟识，说话很是不见外。
“某可不比独孤将军，某是劳碌命，那是汝等长从宿卫的编制，按汝的要求，八个将军，五十个折冲都尉，一百个果毅都尉，上千校尉，都是告身，别人是整理好了送到兵部让某等审核，汝