1.2、灵魂怪兽:新版本怪兽卡面写有灵魂，老版本效果描述区域有灵魂的怪兽卡。该怪兽不能特招召唤，在通常召唤或者反转召唤的当回合结束阶段会回到手牌。
1.3、二重怪兽:卡面写有二重。在场上(未进行二重召唤)和墓地存在时当做通常怪兽使用，可以进行第二次通常召唤使其拥有效果。
1.4、卡通怪兽:卡面写有卡通。动画中贝卡斯所使用的卡组系列。拥有场上存在卡通世界，而对方没有卡通怪兽时，能直接攻击对方玩家的能力。卡通怪兽分为三类型，第一类型出的卡通怪兽需要场上存在卡通世界才能进行召唤或特招，第二类型则不需要，但是，卡通世界被破坏时，自身也会破怪(第一类也一样)，而第三类则不需要卡通世界也能召唤或特招，卡通世界破坏自身也不会破坏。
1.5、同盟怪兽:卡面写有同盟。可以给特定的怪兽当做装备(视作装备魔法卡)，使其拥有特殊能力的系列。部分同盟怪兽可从魔法陷阱区域特殊召唤回场上当做怪兽使用。
1.6、仪式怪兽:卡面为蓝色。需要专属的仪式魔法卡并献出祭品才能使仪式怪兽降临。
仪式召唤:
仪式魔法卡和仪式怪兽同时存在于手牌时发动，根据仪式魔法卡上的文字描述，从手牌或场上献祭出需要仪式召唤的仪式怪兽的等级或以上的怪兽(需1只及以上，可场上和手牌合计)。
2、额外区域的怪兽卡:根据规则，额外区域可以放以下额外怪兽数量0-15张。以下怪兽都不能放在主卡组，需要放在额外区域。
2.1、融合怪兽:卡面为紫色的卡片。以情报栏内所标记的特定怪物和融合魔法卡融合召唤，被标记的怪物被称为融合素材。
融合召唤:
①融合素材在手牌和场上集齐的时候发动融合卡(还有部分特殊融合魔法卡，根据效果来进行融合召唤)。宣布发动后的融合卡放置在魔法陷阱区域内。
②确认融合的发动和效果有效后，把融合素材送入墓地后，在融合卡组内找到相应的融合怪物正面攻击表示或者正面防守表示上场。最后将融合送入墓地。融合召唤结束。
③要使用融合怪物的话在决斗开始前就请将融合卡组背面向上放置在融合区域内，不得互相确认。
融合召唤是融合怪物召唤的正规手段，也有卡的效果的特殊召唤视为融合召唤的情况(例如简易融合)，还有不少融合怪兽是属于接触融合的(不需要融合魔法卡，