前几年戴奥尼亚大力推动和资助希腊各盟邦改进港口设施，和对航路的维护，使得戴奥尼亚舰队在横穿爱琴海的时候，不但可以在附近岛屿得到及时的食水补充，甚至有时在气候好时还可以在夜间赶路，所以等戴奥尼亚舰队抵近小亚细亚近海时，小亚细亚舰队还在赫勒斯滂海域游弋。
小亚细亚舰队将领们得知这个消息之后，根本没有信心同战船数量远超过自己的戴奥尼亚三大舰队进行战斗，也顾得上再为陆军提供帮助，即刻决定率领舰队南返。为了避免与戴奥尼亚舰队迎面撞上，在经过开俄斯岛之后，小亚细亚舰队就开始远离海岸，企图向西南方向航行，绕一个大圈，从而避过戴奥尼亚舰队。
谁知道戴奥尼亚舰队长官们为了防止错过敌人，特地安排第二舰队走近海、第一舰队偏远海、第三舰队在中间连接，各个舰队都拉宽了正面，像张开的一张大网，要网住小亚细亚舰队这条大鱼。
应该说小亚细亚舰队有些幸运，一艘途经的小亚细亚西部城邦商船好意提醒小亚细亚舰队“前方有戴奥尼亚舰队正在向他们行驶而来”，得知消息的波斯将领们顿时慌了神：面对戴奥尼亚舰队的步步紧逼，小亚细亚舰队已经不可能继续向西绕行，否则舰队将深入戴奥尼亚在爱琴海的势力范围，得不到任何补给，很快就会不战自溃，因此摆在他们面前的只有一条路，尽快让舰队靠近小亚细亚海岸，躲进一个城镇的港口，方能避免覆灭的命运。
于是小亚细亚舰队紧急掉头，径直向东急驶，途经萨摩斯岛，在戴奥尼亚舰队追上之前，企图进入以弗所港口。
以弗所是小亚细亚西部沿海的大城，不但城高墙厚，而且物资充裕，小亚细亚舰队完全可以在里面长时间躲避，直到戴奥尼亚舰队不得不离开。
波斯人打的好主意，只可惜戴奥尼亚舰队已有防备，米多拉德斯率领的第二舰队快速穿过了狭窄的萨摩斯海峡，战船在以弗所附近海域呈“一”字展开，以阻截小亚细亚舰队的东逃。
通过快船得知前方情况的小亚细亚舰队将领们面临着前有堵截、后有追兵的危险局面，如同热锅上的蚂蚁，惊慌得不知所措，迫不得已的情况下，带领舰队仓皇逃进了距离他们最近的萨摩斯港。
萨摩斯岛与小亚细亚西部大陆仅有一个狭窄的海峡相隔，这导致它和博斯沃斯岛一样，其实都属于爱欧尼亚岛屿之一，它曾经是雅典建立的提洛同盟的重要成员之一，后来在科林斯战争之后，雅典的实力逐渐恢复，它又再次加入雅典的海上同盟，但雅典被戴奥你