事实上，在战争动员令下达前一个月，海警总司令部便命令全军进入三级战备状态。
各战区警备区一接到命令，便深入进行战备动员；停止所有官兵休假、疗养、探亲和退伍；加强战备值班和通信保障，启封、检修、补充武器装备和战备物资；修订战备方案，进行临战训练；密切注视敌人动向，及时共享情报。
两大警备区主要是防备地方舰队忽然北上，进攻我台湾和大陆地区。虽然这种可能性极低，但战场瞬息万变，任何事情都有可能发生，所以最好的办法就是做好充分准备。
为此，耽罗警备区各水警局的分舰队悉数南下，与台湾警备区的各分舰队共同编组为本土舰队，由台湾警备区司令员海尔哥担任总指挥；耽罗警备区司令员朱珏担任警务委员。
甚至广东总兵官林道乾和接替刚去世的俞大猷，担任福建总兵官胡守仁，都暗中加强了戒备，以防万一。
至于两大警备区的主力舰队，早在台风季到来之前，便已经开赴吕宋，编入战区序列了。
再加上以永夏湾为母港的海警战略舰队和吕宋战区战备舰队，海警部队的四大金刚，在四月份便已经悉数到齐了。
三个月来，四大舰队一直紧锣密鼓的进行编队、作战、夜航等战前训练。台风天没法出海时，全体官兵就疯狂进行体能训练。
练兵场上那句‘战前多流汗、战时少流血’标语，从没像现在这样，被官兵们真心实意奉为圭臬过。
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赵昊也在七月中旬，来到了设在涧内惨案纪念广场上的战区司令部坐镇，监督整体战备工作。
十七日，军区召开了联合作战会议。战区各部门、各舰队双主官，总司令部各厅局主官，总督府、人武部的高层一百余人都出席了这次会议。
会上，海警副总司令、战区司令员兼警务委员金科，先做了战备工作情况报告。
他用了将近两个小时的时间，将前述各部门的具体战备情况，向与会人员做了通报。
最后，金科总结道：“截至本月十五日，战区已经完成了吕宋永夏、玳瑁、望潮、八打雁、丁阿兰五处防御工程的建设，驻守的子弟兵随时可以进驻了。”
总督府和人武部的头头们闻言一阵骚动，战区如此大方，也让他们感到了巨大的压力。
“怎么，有点信心不足？”独坐上首的赵昊，笑问愁眉苦脸的吕宋人武部长西门青道。
万历二年，西门青保护唐保禄来吕宋时，