京察即京官考察，六年一察，在巳、亥年进行，四品以上官员考察后，或升或黜，由皇帝亲自裁决，五品以下的退休、降职、免职和革职各有不同，为了区别于考察外官的外计，又称为内计。京察始于洪武年间，到成化年间逐步成为朝廷考察京官的重要手段，开始形成固定时间考察京官的制度，但到了万历年间，随着朝廷内部的明争暗斗加剧，京察制度也开始变味，成为朋党排除异己打击政敌的工具。
乙巳京察之所以在历史上如此有名是因为这一年的京察彻底掀开了明朝“党.争”的序幕，使得朝堂内的明争暗斗进入白热化，朝廷的政.治生态彻底崩坏，可以说是明朝走向败亡的标志性历史事件。乙巳京察最终让浙党和东林党两败俱伤，首辅沈一贯和次辅沈鲤同时被免，以至于出现内阁无人主事的局面，这是之前从未有过的，连内阁都如此，其他官员就更不用说，在此次京察中，被免职和贬斥的浙党和东林党官员多达数十人，其他未被牵连进去的官员也是人人自危，整个朝堂风声鹤唳，乌云遮天。
原本历史时空的“乙巳京察”还仅限于京城，也不知道是不是因为郭致远这只穿越“小蝴蝶”的影响，这次的京察扩大化了，席卷到了地方，连郭致远的便宜老爹郭正域也受了牵连，当年的“妖书案”被拿出来旧事重提，钱梦皋再次弹劾郭正域有操纵“妖书案”的嫌疑，郭正域因此丢了官，从甘肃巡抚的位子上退了下来，回老家江夏归隐。
福建巡抚徐学聚作为东林党的重要干将也在被弹劾之列丢了官，从这一点来说对郭致远倒是件好事，徐学聚老奸巨猾，视郭致远为眼中钉肉中刺，自然不可能坐视郭致远在东蕃潜心发展自己的势力，可惜没等他对郭致远下手就被卷入了这次党.争之中，这种两党倾轧的斗争，徐学聚再老奸巨猾也难自保，自然顾不上找郭致远的麻烦了，如此一来反倒给了郭致远喘息之机，可以利用这个机会从容地发展自己的势力。
郭致远同样被弹劾了，而且弹劾他的人还不少，有浙党成员也有东林党成员，可笑的是居然还有浙党成员说郭致远是东林党，好在万历皇帝还没有糊涂到家，他还指着郭致远帮他赚银子呢，所以把弹劾郭致远的折子一律留中，郭致远算是躲过一劫。
单从这一点来说，这次“乙巳京察”对郭致远来说还是好处多于坏处，比如这批朝廷派来掺沙子的京官，本来是早该到任的，但因为这次“乙巳京察”导致朝廷政务几乎停滞，才拖到现在，否则要是在郭致远刚到东蕃摊子还没铺开的时候，这批朝廷派来掺沙