牧远联合安室透、怪盗基德、京极真一起，设计在琴酒与走私军火公司社长交易时实施抓捕。
伏特加再遭基德黑手，京极真假扮成走私公司社长，琴酒陷入绝境。
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贝尔摩德趁牧远对琴酒动手，组织实验室监察松懈之际对宫野志保动手，给她喂下了宫野爱莲娜制作的毒药（APTX-4869前身），准备利用易容术，凭借宫野志保的指纹和虹膜潜入组织实验室，销毁APTX-4869的相关研究资料。
千钧一发之际，收到宫野志保催促短信的毛利兰赶到。
贝尔摩德不忍心伤害毛利兰，用出了人体描边枪法，放任两人逃入了海水中。
警方即将抵达，贝尔摩德变装成一位交番的巡查警员离去。
水中，吃下毒药的宫野志保即将窒息，善良的毛利兰毫不犹豫地将自己肺里的空气度给了宫野志保，并亲眼见证了宫野志保变小，灰原哀的诞生。
救命之恩让宫野志保对毛利兰大为改观，甚至暗中将毛利兰与自己的姐姐宫野明美做过比较。
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另一边，热带乐园中，柯南本已逃脱了变小的命运，但由于怀疑牧远对毛利兰有意思、跟踪两人来到热带乐园，从而对牧远展开了反跟踪，被牧远用一记手刀打晕。
琴酒凭借着惊人的直觉与洞察力，感知到了不远处柯南倒下时的动静，柯学时间线再次降临，身为穿越者的牧远因不能良好融入而感觉到了晕车般的眩迷感，昏倒在地。
琴酒喂柯南吃下APTX-4869，时间线闭环。
牧远恢复意识，看到了变小的柯南，终于意识到自己所穿越的世界，就是他前世养肥了好久，本想等点亮心圆后再看的热门动漫——《名侦探柯南》。
柯南剧情正式开始。
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闭合的时间线让柯南世界中的所有人都不会再变老，但牧远除外。
牧远不能确定，这种全世界只有自己会衰老的情况，会不会在他点亮心圆后，对他的心态产生影响，从而导致心圆出现裂痕甚至崩塌，为了以防万一，他选择保护柯南的主线剧情发展，确保在他找不到灰原哀时，灰原哀按照原本剧情自己主动出现。
（牧远对柯南剧情的了解程度，仅仅只是主线的大致方向，以及某几个关键的剧情节点而已。）
因而，牧远化身为面具斗篷人，救下了即将被京极真揍趴下的琴酒。
京极真认出了牧远，并以