没有实行过灭佛之举，但他也曾贬斥佛教、尊崇道教，并且也算是干过一些伤害佛教的事。
早年，赵佶曾听信道士林灵素的话，相信自己是“上帝之长子”神霄玉清王下凡，号“长生大帝君”，下诏通告全国，改天宁万寿宫为神霄玉清万寿宫，在殿上设长生大帝君像。
赵佶又对道录院说：“朕乃昊天上帝元子，为大霄帝君，睹中华被金狄之教焚指炼臂，舍身以求正觉，朕甚悯焉，遂哀恳上帝，愿为人主，令天下归于正道。帝允所请，令弟青华帝君权朕大宵之府。朕夙夕惊惧，尚虑我教所订未周，卿等可上表章，册朕为教主道君皇帝。”
于是，群臣与道录院上表册之。
但赵佶此尊号只适用于教门章疏，而不施行于政事。
后来，赵佶下诏：“佛改号大觉真仙，余为仙人、大士之号。僧为德士，易服饰，称姓氏。寺为宫，院为观，即住持之人为知宫观事。”
不久，赵佶又下诏：“改称尼为女德。”
这些事情，可能都是林灵素在背后谋划和怂恿的。
——林灵素对佛教似乎很有仇恨，他欲废释氏，请求赵佶给佛号全部改名。
赵佶对林灵素深信不疑，于是下旨废佛。
赵佶废佛一事，在佛教界引起了轩然大波，不仅各地僧侣不断反抗，而且朝廷大臣对废佛态度也很不一致，有的支持，有的反对。
后来，林灵素因故遭到罢斥流放，不久被赐死。
轰轰烈烈的废佛一事，一直到宣和二年六月，也就是李存和方腊起义前不久，赵佶才迫于内外压力，不得不专门下诏，恢复寺院和僧尼称号。
可是，赵佶废佛对佛教界造成的伤害，恐怕并不是一道诏书就能修复好的。
这不，就有浮屠氏来找赵佶报仇了嘛。
前脚那个僧人刚被王时雍给弄死，后脚童贯的急报就到了。
赵佶一目十行的看完童贯的急报了之后，人就是一晃，随即一屁股就坐到了地上。
完了！
大宋王朝完了！
他赵佶也完了！
张迪见此，赶紧过来将赵佶搀扶到了龙椅之上。
缓了好一会，赵佶才急匆匆的对张迪说：“快！快宣宰执们觐见！”
……
与赵佶那里如同天塌下来了一般相比，李存这里则完全是另外一番光景。
大乾王朝的臣民也在兴高采烈的庆祝下元节。