不出宋友亮的预料，当倒幕军得到江户暴乱的消息时，便冒险绕过小田原直扑江户。可由于在小田原耽误了时间，等倒幕军到达江户时，幕府军已经平定了暴乱，由井正雪和长宗我部盛澄等一班骨干人员在锦衣卫的掩护下从海路撤退，逃亡中国。
于是幕府军以逸待劳，一举击破了宇喜多秀家指挥的倒幕军。于是倒幕军向京都溃退。
京都，是当时日本的国都、佛教中心、神道教圣地、文化艺术摇篮，位于本州岛中西部，座落在京都盆地北部，东距日本第一大湖琵琶湖仅5公里，东、西、北三面有丹波山地、比良山地和贵船山地环绕，市区随京都盆地向南面大阪湾敞开为巨型口袋形状地处低平盆地，三面环山。卡莫河、桂河等河流经市区与市南丽河会合。公元794年（延历13年），当时的桓武天皇为断绝佛教涉入政治的恶风，把皇都由奈良迁到长风，同时派人营造现在的京都城，随后把国都迁到京都，当时称之为「平安京」，京城型式制度完全仿照中国长安城的体制，桓武天皇并仿中国大唐的律令制度，整顿日本的政治，同时建立新的佛教宗派，使政教分离。在鎌仓幕府形成之前的一千多年中，京都可说是日本的政经文化中心，到了丰臣秀吉、织田信长时代，虽然皇权不张，但两朝大将军对京都的体制保护有加。
整个京都城城区房屋依盆地山坡而建，街道上下起伏，高野川和贺茂川在市区汇合成鸭川向南流入桂川，青山绿水，交相辉映，神殿古庙、皇宫御园分布在起伏的街道两侧，错落有序。城北中央为皇室所在的宫城，宫城之外是作衙署之用的皇城，而皇城之外是作为一般官吏、平民居住的都城。全城面积约20平方公里，呈长方形，街道纵横，对称相交，形如棋盘，因而日本人总喜爱称京都为“洛阳”、“洛城”。
皇宫西南是幕府将军是在十几年前建立的二条城，也就是将军府。永禄十二年（1569），织田信长在足利义昭的居处开始兴建二条城。天正元年（1573），信长流放义昭后烧毁了这座城，然后在其它地方另筑二条御所，并将之献给城仁亲王。天正十年（1582），本能寺事变爆发。信长长子信忠在二条御所放火自刃。关原之战后，得到天下的家康在京都会见丰臣秀赖时重新修筑。这座二条城高墙深堑，戒备森严。虽然将军一般不住在京都，但他在京都拥有的宫殿跟皇宫的规模差不多，这个府第拥有良好的防御措施。建有东西约500米、南北约400米的高大围墙，并挖有壕沟。二条城内名为“鹂鸣地板”的走廊，人行走其