井筒开凿至煤层后，就要布置和挖掘巷道，准备采煤工作面。明代已经懂得根据煤层的走向、倾角和厚度布置上山、下山和运输、通风巷道。这在孙廷铨《颜山杂记》中有明确记载：“已得炭然后旁行其隧”，“井得炭而支行”（“隧”指主要巷道，“支行”指由主巷到工作面的小巷道）。“其行隧也如上山，左者登，右必降，左者降，右必登，降者下墄，登者上墄，循山旁行而不得平，谓之反墄（墄指阶齿）。”其意思是讲，要想采出不同位置的倾斜煤层，需要布置上山或下山，与采煤工作面连系。古代煤窑，通常采掘合一，掘进巷道也就是采煤。明代的巷道延深可达数十百丈。掘进巷道（往往即是采煤）所用的工具主要有凿、锤、镐、钎。
矿道挖好后，为了防止巷道和工作面塌落冒顶，支护是重要的。古代支护方法基本可分为人工支护和留煤柱支护。煤层及其围岩较软、较破碎时，用人字形木支架或二柱一梁木支架或方框支架支护。若煤及其围岩较坚硬时，一般不加支护或留煤柱支护。在徐富贵矿师的指挥下，在巷道的部署上，也是非常的科学。这时已经懂得根据煤层的走向，布置上山下山，还有运输与通风地巷道，最后建成地密密麻麻的各种巷道。此外在井下地支护上，在杨师傅的指挥下，矿工们采用了二柱一梁的木支架方法，最大地防止了巷道和工作面塌落冒顶。由于宋友亮舍得投入，有制造出了水泥，所以井下原本通常是用木头支架的地方全部用上了金属支架，还用水泥加固矿道。就连徐富贵也直说这矿道想塌都难。
接着是矿井通风问题，明代矿井一般采用自然通风或人工通风。人工通风的办法，主要是用风车、风柜、风扇、牛皮囊等往井内扇风，但是这只对浅层煤矿开采有效。所以徐富贵采用的是自然通风法。
又分为单井筒通风和双井筒通风。双井筒通风较为普遍。明代《颜山杂记》对双井筒通风作了明确的记载：“是故凿井必两，行隧必双，令气交通，以达其阳，攻坚致远，功不可量。以为气井之谓也。”专门用作通风的出风井，通常选择在较高处（进风井在低处），这有利于自然风流的流动。单井筒通风，多采用表风法，即在井筒的一角，用片石砌成一个三角形的回风道，回风道高出井筒，形如烟囱，名曰“噘咀”。风从井口进入井下，到采煤工作面，再经过用表墙隔出的回风道，由噘咀流出。单井筒通风最简单的方法是将一竹筒（南方有一种径粗如碗的竹子，凿去中节）放入井中，竹筒高出井口，井下即可形成自然风流，由竹筒抽出瓦斯等废气。