道衍见朱棣一脸悲壮，还以为他说的什么孤注一掷、冒险一搏是起兵造反，想不到
王爷，你是想做一条真龙，还是一头真猪啊！
道衍对朱棣的感情非常复杂，如子如侄、亦师亦友，还有一种士为知己都死的感动。
洪武十五年，马娘娘病逝，诸王赴京奔丧，悲痛玉绝的洪武大帝为儿子们每人都配了一个僧侣随他们回就藩之地，让他们随侍诸王，为马皇后诵经祈福。二十多个藩王，每人身边都配了一个僧人。如今十六年过去了，当初那些僧侣可有一个成为一座大寺院的方丈主持？可有一个被亲王敬若上宾，如师如友？
朱棣从来没有把道衍当成一个普普通通的侍讲僧人，随便丢在哪个角落里，由着他自生自灭，他对道衍一直礼敬有加，十多年相处下来，两人亦师亦友，感情十分深厚。除了私谊，道衍对朱棣的才干、勇武，也是衷心的佩服。
建文登基以后，对诸王步步紧bi，尤其是燕王，更成了他的眼中钉，必玉置之死地而后快，道衍身在北平，感同身受，对朱棣，他是有一种同仇敌忾的情绪在里面的。
此后，方孝孺成为建文帝第一智囊。方孝孺对佛教的态度同他的老师宋濂截然不同，宋濂对诸子百家学说，都抱着一种宽容的态度，他本人做为明初第一大儒，也有许多佛家好友，而方孝孺对佛教则深恶痛绝，认为佛教没有君臣父子夫妇长幼之分，无父无君、无亲无友，败坏伦常，乃是邪教异端。佛经中一些劝人向善的道理，他也认为儒教中已经全都包含在内，所以慕佛不如慕儒，安家治国平天下，独尊儒术足矣。
在方孝孺的影响下，朱允炆下召抑制佛田、限制佛产，对佛教的控制较朱元璋的时候更加严厉。其实尊佛、灭佛，在史上反反复复，随着统治者的态度几起几落，这也不是头一回了。这条政策于国于民的功过得失正确与否这里且不论，但有一点却是不容质疑的，那就是：它把佛教弟子推到了朝廷的对立面上。
佛教弟子虽然不会因此就悍然与统治者针锋相对，但是如果有人挑起这面与朝廷为敌的大旗时，他们倾向于谁，站在谁的一面，那就勿庸质疑了。所以到后来朱棣起兵“靖难”时，河南嵩山少林寺就坚决地站到了燕王朱棣一边，派出八百僧兵协助燕王，八百条疯魔棍在战场上所向披靡，为朱棣立下了汗马功劳。
朱允炆抑佛，道衍身为佛教弟子，对朱允炆又哪能有什么好感。私谊公义，无论从哪一边算，他都只会把自己和燕王紧紧地绑在一起，与燕王休戚与共